针对iPhone6s系列机种分别采用由台积电16nm制程技术，以及三星14nm制程技术的A9处理器效能与电池续航表现争议，苹果认为两种处理器实际表现仍因不同使用情境而有差异。
虽然苹果并未明确公布iPhone6s系列机种所采用A9处理器分别由台积电与三星代工制作，但不少市场消息与数据均已直接或间接证实此项作法，甚至部分数据更显示由台积电16nm制程技术生产A9处理器，其实有更好的效能表现及电池续航表现，因此造成后续部分消费者倾向挑选搭载台积电生产版本处理器的iPhone6s。
而为平缓市场讨论争议影响iPhone6s实际销量，苹果稍早释出官方声明内容，除确认iPhone6s确实由两家厂商代工生产处理器元件，同时强调两种制程技术生产的处理器均符合苹果要求标准，同时也说明两种不同制程技术确实会有约2-3%的效能差异，但并不影响实际使用。此外，即便是相同硬体规格的iPhone6s在不同使用情境下，也可能反应不同效能与电池续航表现。
两种制程技术所生产的处理器之所以产生细微差异，除在于制程技术架构设计不同以外，也包含不同制程所对应使用电压差异，导致整体机身发热表现也将有差别。
目前市面开始流传不同识别iPhone6s处理器是否为台积电制程技术生产的方式，或是强调不同区域贩售的特定规格iPhone6s采用台积电制程生产处理器比例，但实际使用其实不见得会有明显差异，毕竟实际使用仍会有不同变因影响效能表现，进而影响实际耗电结果